Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TOP3BO95985 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOP3BO95985 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms