Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC24BO95487 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC24BO95487 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms