Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP5O95183 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms