Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PPFIA2O75334 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA2O75334 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms