Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN2O75298 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN2O75298 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN2O75298 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN2O75298 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN2O75298 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RTN2O75298 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RTN2O75298 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN2O75298 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN2O75298 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN2O75298 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN2O75298 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN2O75298 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RTN2O75298 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTN2O75298 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTN2O75298 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTN2O75298 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTN2O75298 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN2O75298 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN2O75298 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTN2O75298 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTN2O75298 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms