Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRP9O43818 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP9O43818 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP9O43818 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP9O43818 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP9O43818 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP9O43818 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RRP9O43818 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP9O43818 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP9O43818 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP9O43818 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRP9O43818 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRP9O43818 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRP9O43818 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms