Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXA2O43364 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms