Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAPO00193 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMAPO00193 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMAPO00193 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMAPO00193 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAPO00193 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAPO00193 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAPO00193 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAPO00193 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMAPO00193 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMAPO00193 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms