Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3KT08 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3KT08 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3KT08 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3KT08 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
J3KT08 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3KT08 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3KT08 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
J3KT08 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
J3KT08 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
J3KT08 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms