Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00587B1AMM8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00587B1AMM8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms