Protein–RNA interactions for Protein: A8MU46

SMTNL1, Smoothelin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNL1A8MU46 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMTNL1A8MU46 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMTNL1A8MU46 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms