Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MAP1LC3B2A6NCE7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms