Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-204ENST00000586558 1127 ntTSL 220.49■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 TSC2-209ENST00000463601 600 ntTSL 320.46■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.857e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SIGIRR-216ENST00000528845 573 ntTSL 220.05■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 TLE3-217ENST00000559574 325 ntTSL 519.98■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-215ENST00000452773 665 ntTSL 219.74■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-224ENST00000489087 512 ntTSL 419.63■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-212ENST00000590260 988 ntTSL 219.49■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GPSM3-208ENST00000472768 1417 ntTSL 219.28■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-223ENST00000583582 1350 ntTSL 219.09■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-210ENST00000577248 571 ntTSL 419.04■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-216ENST00000579479 560 ntTSL 419.04■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-211ENST00000590098 795 ntTSL 218.97■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SF1-212ENST00000463343 983 ntTSL 218.95■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CKB-215ENST00000557287 565 ntTSL 218.91■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-218ENST00000635628 2812 ntTSL 418.9■□□□□ 0.627e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-218ENST00000580551 554 ntTSL 218.83■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-210ENST00000430102 702 ntTSL 318.74■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ESPL1-208ENST00000553016 1320 ntTSL 518.73■□□□□ 0.593e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DOCK8-212ENST00000479404 595 ntTSL 318.72■□□□□ 0.597e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-212ENST00000578254 562 ntTSL 518.67■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PTPRVP-203ENST00000638692 1189 ntTSL 1 (best)18.63■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.567e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CREB1-204ENST00000421139 713 ntTSL 518.54■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.57e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-203ENST00000586486 1613 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-206ENST00000413561 1857 ntTSL 217.97■□□□□ 0.477e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1L-215ENST00000515719 382 ntTSL 217.92■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-203ENST00000443521 673 ntTSL 517.91■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 217.9■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RNF10-207ENST00000536869 644 ntTSL 517.83■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PPP2R1A-204ENST00000462047 561 ntTSL 217.78■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-207ENST00000484773 916 ntTSL 317.69■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-228ENST00000585214 566 ntTSL 417.53■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KAT5-217ENST00000534681 583 ntTSL 217.42■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-204ENST00000460894 584 ntTSL 517.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-221ENST00000582874 591 ntTSL 317.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ASAP3-204ENST00000465372 936 ntTSL 517■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 FNTA-205ENST00000526755 4676 ntTSL 1 (best)17■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-225ENST00000583718 550 ntTSL 416.82■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-216ENST00000591275 484 ntTSL 216.78■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-222ENST00000583419 579 ntTSL 416.64■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF445-203ENST00000460529 1312 ntTSL 1 (best)16.61■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.237e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PTPRVP-204ENST00000639439 821 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.227e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-211ENST00000578232 851 ntTSL 216.39■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-211ENST00000590239 565 ntTSL 416.27■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PRKCSH-204ENST00000587290 780 ntTSL 216.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PDCD6-211ENST00000515587 855 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KAT5-210ENST00000531880 845 ntTSL 316.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-208ENST00000488876 2404 ntTSL 215.98■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PRKDC-203ENST00000432581 583 ntTSL 215.73■□□□□ 0.117e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 STARD3-220ENST00000581894 591 ntTSL 315.64■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KRIT1-217ENST00000458177 1472 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MRFAP1L1-202ENST00000500563 2127 nt15.38■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 SZRD1-206ENST00000475078 490 ntTSL 415.25■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DHX30-212ENST00000474183 963 ntTSL 215.22■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 LDLRAP1-205ENST00000484476 657 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RNF10-212ENST00000538796 1206 ntTSL 514.73□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.087e-9■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 TSC2-211ENST00000467949 590 ntTSL 414.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 DAXX-207ENST00000468536 817 ntTSL 214.43□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KAT5-206ENST00000527544 745 ntTSL 214.4□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 KAT5-207ENST00000528198 609 ntTSL 414.21□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 28.8
UTP3Q9NQZ2 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 28.8
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3846.1 ms