Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.964e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 ATL2-214ENST00000477642 764 ntTSL 23.89□□□□□ -1.794e-7■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 ACSS3-204ENST00000548324 2214 ntTSL 29.06□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 BUB1B-208ENST00000559461 477 ntTSL 29.66□□□□□ -0.861e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPTA1-208ENST00000492934 771 ntTSL 26.66□□□□□ -1.341e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 HNRNPR-207ENST00000470941 560 ntTSL 46.34□□□□□ -1.391e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPTA1-209ENST00000498708 600 ntTSL 35.03□□□□□ -1.61e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 BUB1B-203ENST00000557848 633 ntTSL 34.57□□□□□ -1.681e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 BUB1B-209ENST00000559733 786 ntTSL 33.13□□□□□ -1.911e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 BUB1B-210ENST00000559772 560 ntTSL 42.03□□□□□ -2.081e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 MED24-226ENST00000580921 574 ntTSL 312.87□□□□□ -0.351e-9■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SREBF2-206ENST00000464119 432 ntTSL 212.23□□□□□ -0.455e-9■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SREBF2-204ENST00000462539 796 ntTSL 27.79□□□□□ -1.165e-9■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 HNRNPA1-211ENST00000551665 925 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-21■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 HNRNPA1-214ENST00000551803 372 ntTSL 33.74□□□□□ -1.811e-21■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 AHCY-206ENST00000606061 1170 ntTSL 219.23■□□□□ 0.671e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.062e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 C22orf34-202ENST00000400023 1469 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.062e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 413.56□□□□□ -0.242e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-209ENST00000474602 4960 ntTSL 1 (best)22.74■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.852e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.592e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-206ENST00000452280 804 ntTSL 317.54■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-204ENST00000412285 5271 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-205ENST00000415608 684 ntTSL 56.42□□□□□ -1.382e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 CDC14B-213ENST00000496750 649 ntTSL 33.71□□□□□ -1.822e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TFRC-207ENST00000463356 533 ntTSL 36.7□□□□□ -1.341e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SOAT2-203ENST00000551896 570 ntTSL 215.33■□□□□ 0.043e-8■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.422e-9■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.892e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPCS2-208ENST00000532972 839 ntTSL 217.23■□□□□ 0.352e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPCS2-204ENST00000527225 321 ntTSL 516.13■□□□□ 0.172e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TTLL3-218ENST00000443148 2031 ntTSL 215.88■□□□□ 0.131e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 P2RY11-202ENST00000471843 554 ntTSL 414.75□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 RACGAP1-214ENST00000548644 624 ntTSL 313.96□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 FCGR2C-203ENST00000467903 1101 ntTSL 313.88□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TRIP6-207ENST00000488670 615 ntTSL 313.77□□□□□ -0.211e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TTLL3-215ENST00000438141 1743 ntTSL 213.48□□□□□ -0.251e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 DNMT1-205ENST00000585920 529 ntTSL 312.78□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 FCGR2C-202ENST00000466542 1070 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.621e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TTLL3-233ENST00000602338 693 nt11.01□□□□□ -0.651e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 AGAP3-213ENST00000475145 413 ntTSL 210.93□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 FCGR2C-212ENST00000611236 958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.711e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 510.54□□□□□ -0.721e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 AC005394.1-201ENST00000589999 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 FCGR2C-204ENST00000473530 1632 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 FCGR2C-211ENST00000543859 1507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SRRM1-204ENST00000461768 496 ntTSL 38.22□□□□□ -1.092e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 USP10-212ENST00000566378 465 ntTSL 58.09□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SRRM1-214ENST00000485541 679 ntTSL 58.07□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SRRM1-220ENST00000496882 834 ntTSL 57.34□□□□□ -1.232e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 DHX9-205ENST00000479271 316 ntTSL 57.1□□□□□ -1.272e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPCS2-206ENST00000528265 577 ntTSL 56.83□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 RACGAP1-223ENST00000551260 555 ntTSL 45.16□□□□□ -1.582e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.672e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SRRM1-215ENST00000488317 333 ntTSL 24.14□□□□□ -1.752e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 USP10-209ENST00000563433 540 ntTSL 23.88□□□□□ -1.792e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SPCS2-203ENST00000526883 498 ntTSL 23.74□□□□□ -1.812e-6■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SLC51A-208ENST00000475271 766 ntTSL 214.58□□□□□ -0.085e-17■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SLC51A-212ENST00000484407 1066 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.425e-17■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SLC51A-209ENST00000475672 1208 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.715e-17■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 IFRD1-207ENST00000440625 891 ntTSL 48.57□□□□□ -1.048e-11■□□□□ 8.7
EFTUD2Q15029 SLC39A5-210ENST00000481103 926 ntTSL 214.03□□□□□ -0.161e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SLC39A5-206ENST00000436633 871 ntTSL 513.32□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 FTCD-208ENST00000480950 318 ntTSL 324.11■■□□□ 1.454e-22■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 FTCD-207ENST00000469240 458 ntTSL 318.92■□□□□ 0.624e-22■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SMCHD1-205ENST00000581383 806 ntTSL 34.07□□□□□ -1.762e-11■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 HSPE1-204ENST00000463841 700 ntTSL 23.99□□□□□ -1.773e-19■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 AC010132.3-202ENST00000433579 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.27■■□□□ 12e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-212ENST00000490223 1785 ntTSL 220.89■□□□□ 0.932e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-206ENST00000422218 588 ntTSL 416.46■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 WDR60-204ENST00000454771 812 ntTSL 415.11■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RINT1-206ENST00000493041 563 ntTSL 514.21□□□□□ -0.132e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RINT1-205ENST00000482041 578 ntTSL 414.16□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.252e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RINT1-202ENST00000467392 837 ntTSL 313.23□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-210ENST00000456530 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PRC1-206ENST00000555455 830 ntTSL 311.43□□□□□ -0.584e-14■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TMEM56-202ENST00000455656 609 ntTSL 511.27□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-204ENST00000413699 2053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.642e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-211ENST00000465786 1729 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.672e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PSMD11-210ENST00000584340 559 ntTSL 410.48□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PSMA2-201ENST00000223321 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-203ENST00000412097 562 ntTSL 59.68□□□□□ -0.862e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 RPL15-207ENST00000434031 650 ntTSL 59.36□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 8.6
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