Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
V9GYQ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
V9GYQ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
V9GYQ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
V9GYQ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms