Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG6Q9Y2V7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG6Q9Y2V7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms