Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POMPQ9Y244 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POMPQ9Y244 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms