Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HHLA3Q9XRX5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms