Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SORCS3Q9UPU3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS3Q9UPU3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms