Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms