Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ABRACLQ9P1F3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRACLQ9P1F3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms