Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCDC59Q9P031 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms