Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DLL3Q9NYJ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DLL3Q9NYJ7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms