Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC5A4Q9NY91 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms