Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HELLSQ9NRZ9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HELLSQ9NRZ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HELLSQ9NRZ9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms