Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OTORQ9NRC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTORQ9NRC9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms