Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTN4Q9NQC3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN4Q9NQC3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms