Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM49AQ9H0Q0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM49AQ9H0Q0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms