Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP1Q9GZU7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms