Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHLHE41Q9C0J9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms