Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LNPKQ9C0E8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LNPKQ9C0E8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms