Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms