Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms