Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UPK3BQ9BT76 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UPK3BQ9BT76 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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