Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C16orf70Q9BSU1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C16orf70Q9BSU1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms