Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC50A1Q9BRV3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC50A1Q9BRV3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms