Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNS3Q9BQ31 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNS3Q9BQ31 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms