Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ARID3AQ99856 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARID3AQ99856 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARID3AQ99856 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms