Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ODF3Q96PU9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms