Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCLT1Q96NL6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCLT1Q96NL6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms