Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VPS50Q96JG6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms