Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
COG3Q96JB2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
COG3Q96JB2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms