Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
APIPQ96GX9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APIPQ96GX9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms