Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
BCANQ96GW7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
BCANQ96GW7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms