Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RNFT2Q96EX2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms