Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMIM12Q96EX1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM12Q96EX1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms