Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MTERF3Q96E29 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MTERF3Q96E29 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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