Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C18orf8Q96DM3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms