Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms