Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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TRIM63Q969Q1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM63Q969Q1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRIM63Q969Q1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRIM63Q969Q1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRIM63Q969Q1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRIM63Q969Q1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TRIM63Q969Q1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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TRIM63Q969Q1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM63Q969Q1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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